Muzeul este amenajat într-o clădire special construită în anul 1912, după planurile arh. Kós Károly. Cuprinde secții de arheologie, etnografie, științele naturii, artă, biblioteca - carte veche, istorie. Sunt expuse piese de arheologie (obiecte din paleolitic până în secolul al XII-lea), tezaure monetare, etnografie (obiecte legate de ocupațiile locuitorilor din zonă, port, mobilier, țesături), istorie naturală (mineralogie, paleontologie, păsări, fluturi).
Expoziția permanentă a Secției Istorie-Arheologie cuprinde următoarele tematici: Revoluția de la 1848-1849 din Trei Scaune; Vestigii arheologice din Sud-Estul Transilvaniei; Secuii. Apărătorii creștinătății (expoziție care va fi deschisă publicului începând din primăvara 2009)
Expoziția permanentă a Secției Etnografie cuprinde următoarele tematici: Meșteșuguri și ocupații din Trei Scaune; Obiceiurile generațiilor; "Te-am dus păgân, te-am adus creștin" - Copilăria în zona Secuimii; Casa țărănească de la Potiond.
Expoziția permanentă a Secției Științele Naturii cuprinde următoarele tematici: Flora și fauna - S.O.S. Natura; Expoziția de paleontologie; Expoziția de roci și minerale.
Deține bunuri culturale clasate în Tezaurul patrimoniului cultural național.